Düz kafa sendromunda bebek, gelişimin gecikmesine ve öğrenmenin yavaşlamasına yönelik yüksek bir risk taşımaktadır. Çocuk okul çağına ulaştığında özel eğitime ihtiyaç artmaktadır. Diş yapısı ve çene eklemine yönelik sorunlar, tıpta skolyoz diye adlandırılan omurga eğriliği, astigmat ve görüş alanı kusurlarını içeren görme bozuklukları, işitme problemlerinin yanı sıra sosyal ve psikolojik sorunlara yol açmaktadır.


Son yıllarda, klinik çalışmalar ve araştırmalar düz kafa sendromu ile ilgili uzun vadeli etkileri  hakkında şu bilgilere ulaşılmıştır: